一、各种剧毒农药、刚喷洒了农药的作物茎叶、刚消过毒的禽畜粪便、中毒死亡的禽畜尸体都不能入池。如发生这种情况，应将池内发酵料液全部清除，并用清水将沼气池冲洗干净，然后重新加料；不准把油麸、骨粉、棉籽饼和磷矿粉等含磷较高的物质加入沼气池，以防产生对人体有严重危害的剧毒气体——磷化三氢。
二、沼气池的进出料口要加盖，平时出料、搅拌维修后一定要注意及时封好盖板，防止人畜掉进池内造成伤亡。
三、要经常观察压力表的变化，当池子产气旺盛，沼气压力太高时，要及时用气或放气，以防涨坏气箱，最好装上沼气安全阀，当压力达到一定限度时，可自动放气，可避免冲开池盖、保护管道正常运行。如池盖一旦被冲开，要立即熄灭沼气池附近的烟火，以免引起火灾。压力太低时，应尽快检查漏气原因，及时维修；一次进、出料量较多时，应打开输气开关，以免产生负压，损坏池子。
四、禁止在沼气池导气管口和出料口处点火试气，以免引起回火，产生爆炸；禁止使用明火检查各处接头、开关的漏气情况，检查漏气应用洗衣粉或肥皂的泡沫涂刷，发现气泡，说明漏气，要及时处理；禁止向池内丢明火烧余气，防止气与火接触引起池子爆炸。
五、在室内发现漏气或有臭皮蛋味时，不准使用电源开关、火柴、油灯、蜡烛、打火机等明火，应迅速打开门窗，采取扇风、鼓风等方式将沼气排出室外，净化空气，直至异味消失，以防引起火灾，发生意外情况。
六、沼气灯、炉具和输气管应安置在安全、方便、远离柴草、木板等易燃物品存放的地方，以防失火。一旦发生火灾，应立即关闭开关，切断电源。
七、使用前请接通气源，紧固各接头，用肥皂水检查各接头是否有漏气现象（灶前压力保证20厘米水柱以上）。
八、新建沼气池或新投料沼气池刚产生一些气后不能使用脉冲或电子点火，因新池产生沼气过程中还有相当一部分空气等杂气，故可燃成比例低。用明火先点一段时间待风门调节到三分之一或四分之一时能正常燃烧，不脱火后才能用电子点火。
九、发现燃烧不正常时，请调节风门来控制，空气适量时火焰旦蓝色、稳定、清晰；空气不足，火焰发黄而长；空气过量时，火焰短而跳跃，并出现离焰现象。
十、使用过程中火焰被风吹灭或被水淋熄，应立即关闭开关，打开窗户疏通空气，此时严禁使用一切火种及电源开关以免发生意外。
十一、已投料的沼气池，不管是否产气运行，均不谁轻易下池进行出料或检修。凡是需要下池，一定要做好安全防护措施：一是打开活动盖，在池外出料，使进料口、出料口、活动盖口三口通风或用鼓风办法更新池内全部空所；二是把小动物（鸡、鸭、猫等）放入池内，观察15－30分钟，如动物活动正常，方可下池，否则严禁下池，以免发生窒息中毒事故；三是下池人员腋下系上安全绳，池外要有专人看护。下池人员稍感不适，池外看护人员应立即将其拉出池外，到通风阴凉处休息；四是揭开活动盖时，不得在池口周围点明火照明或吸烟，进池人员只能用手电或镜子反光照明，严禁使用明火。
十二、一旦发生池内人员昏倒，而又不能迅速救出时，应立即采用人工办法向池内送风，输入新鲜空气，切不可盲目进池抢救，以免造成连续发生窒息中毒事故。更新空气后，下池人员一定要遵照安全防护措施进行救人，将窒息人员救出后要抬到地面避风处，解开上衣和裤带，注意保暖，并立即就近送医院抢救。凡已确定报废的沼气池，一定要及时进行填埋处理，以免留下安全隐患。
